Управление Центром обучения ПАО «СУС» осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации, Положением о Центре обучения и строится на принципах единоначалия и коллегиальности.
Непосредственное руководство образовательной деятельностью осуществляется директором Центра обучения. Общее руководство и координацию деятельности Центра обучения осуществляет Генеральный директор ПАО «СУС».
В Центре обучения создан педагогический совет. Его деятельность регламентируется Положением о педагогическом совете.